研究揭示兒童癌癥致病基因
來自約翰霍普金斯大學Kimmel癌癥中心和費城兒童醫(yī)院(CHOP)的科學家們在對74個兒童神經(jīng)母細胞瘤進行全基因組測序后,發(fā)現(xiàn)ARID1A和ARID1B兩個基因發(fā)生改變的患兒相比無此基因改變的患兒生存期縮短了四分之三。這一發(fā)現(xiàn)有可能最終導致早期確認患有侵襲性神經(jīng)母細胞瘤的兒童,他們或許需要接受其他的治療。相關論文發(fā)表在12月2日的《自然遺傳學》(Nature Genetics)雜志上。
神經(jīng)母細胞瘤累及全身神經(jīng)組織,是最常見的一種兒童惡性實體瘤。約翰霍普金斯大學癌癥生物學計劃聯(lián)合主任、腫瘤學教授Victor Velculescu 博士說:“這些癌癥具有廣泛的臨床結局,一些治愈的機會很高,而另一些則是相當致命的。出現(xiàn)這種預后多樣性,部分原因可能是由于ARID1A和ARID1B基因的改變。”
Velculescu說在以往其他的神經(jīng)母細胞瘤基因測序研究中沒有發(fā)現(xiàn)這些強大的“惡棍”(bully)基因。新研究能鑒別出它們,很有可能是因為約翰霍普金斯大學CHOP的研究人員采用測序和分析方法,除找到了單個堿基對序列的改變,還篩查了DNA更大的結構重排。
在本研究的74個腫瘤中,有71個進行了重排和堿基對改變分析。研究人員在過去顯示與神經(jīng)母細胞瘤有關聯(lián)的多個基因,包括ALK和MYCN基因中發(fā)現(xiàn)了癌癥特異性的突變。他們還發(fā)現(xiàn)71名患者中8人有ARID1A和ARID1B基因的改變,這兩個基因通常情況下通過調(diào)控DNA折疊方式來影響蛋白質合成。
具有ARID1A和ARID1B基因改變的兒童平均生存期只有386天,相比之下沒有這些遺傳變異的兒童則達到1,689天,兩者相差甚遠。然而除一人之外,所有這些患者均死于侵襲性疾病,包括一名被認為治愈機會很高的神經(jīng)母細胞瘤患兒。
在本研究中,科學家們還檢測和監(jiān)控了四名患者血液中神經(jīng)母細胞瘤特異性的遺傳改變,并將確定了這些調(diào)查結果與疾病進程之間的相互關聯(lián)。
“在血液中尋找癌癥特異性的改變,可能有助于臨床醫(yī)生監(jiān)控患者的復發(fā)情況,確定手術后體內(nèi)是否還有殘留癌細胞,”本研究的首席科學家之一、約翰霍普金斯大學研究生Mark Sausen說。
約翰霍普金斯大學CHOP研究小組計劃在更大規(guī)模組群患者中開展進一步地研究,以證實ARID1A-ARID1B與預后相關。