《中共中央國務院關于深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革的意見》強調(diào)，要大力推進醫(yī)藥衛(wèi)生信息化建設。但是，目前國內(nèi)許多醫(yī)院信息化建設都是各自為政，開發(fā)的系統(tǒng)數(shù)據(jù)結構和格式不統(tǒng)一，無法互聯(lián)互通，造成資源和資金的浪費。另外，國內(nèi)的醫(yī)療信息化建設還存在個人隱私、信息安全等問題。

對于醫(yī)療信息技術整體水平低和缺乏統(tǒng)一標準的問題，一位業(yè)內(nèi)專家用“戰(zhàn)國時代”來形容當前的醫(yī)療信息技術市場。以北京為例，3000多家醫(yī)療信息企業(yè)形成了白熱化的競爭，微利之下企業(yè)根本沒有錢去搞研發(fā)，技術水平低下。而且沒有形成產(chǎn)品、技術和服務的整體集成，與國外在購買軟件、硬件、服務方面的投入各占三成不同，我國購買醫(yī)療信息產(chǎn)品時，硬件和軟件的投入各占到70%和30%，人的服務缺位。

“在醫(yī)院的醫(yī)療信息化項目招標中，沒有形成統(tǒng)一的標準，對相關行業(yè)沒有一個準入門檻，導致市場上產(chǎn)品良莠不齊，很多醫(yī)院購買的軟件用了兩三年就不行了，然后推倒重來。此外標準不統(tǒng)一也造成了醫(yī)院之間的信息共享障礙。”上述專家呼吁政府對醫(yī)療信息產(chǎn)業(yè)設立準入門檻，同時出臺一套統(tǒng)一的標準，對整個市場進行規(guī)范。

中國社會科學院醫(yī)療與產(chǎn)業(yè)發(fā)展研究中心執(zhí)行主任趙強表示，醫(yī)療信息化前期需要大筆資金投入，包括對操作流程進行重新設計及對醫(yī)護和管理人員進行大量培訓，這需要大量人力、物力和時間的投入，能不能成功還有一定風險，即便成功其經(jīng)濟效益也不可能立竿見影。所以一個地區(qū)、一家醫(yī)院是不是進行大規(guī)模的醫(yī)療信息化改造，資金如何籌措，達到什么目標，效果如何評估，都影響著這個決策的結果。

趙強建議，政府首先應該鼓勵和擴大在醫(yī)療信息基礎建設方面的投入，也就是醫(yī)療機構電子病歷系統(tǒng)的建設和應用，包括二三級醫(yī)院和基層醫(yī)療機構。在這一目標達成的同時，鼓勵這些機構統(tǒng)一行動進行信息共享，減少重復檢查等醫(yī)療資源浪費現(xiàn)象，提高醫(yī)療效率。